Parcourir Faculté des arts et des sciences – Département d'informatique et de recherche opérationnelle - Thèses et mémoires par directeur·trice de recherche "El-Mabrouk, Nadia"
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Algorithmes de construction et correction d'arbres de gènes par la réconciliation
(2016-09-28)Les gènes, qui servent à encoder les fonctions biologiques des êtres vivants, forment l'unité moléculaire de base de l'hérédité. Afin d'expliquer la diversité des espèces que l'on peut observer aujourd'hui, il est essentiel de comprendre comment ... -
Assessing the robustness of genetic codes and genomes
(2020-12-16)Deux approches principales existent pour évaluer la robustesse des codes génétiques et des séquences de codage. L'approche statistique est basée sur des estimations empiriques de probabilité calculées à partir d'échantillons aléatoires de permutations ... -
Edit distance metrics for measuring dissimilarity between labeled gene trees
(2020-12-16)Les arbres phylogénétiques sont des instruments de biologie évolutive offrant de formidables moyens d'étude pour la génomique comparative. Ils fournissent des moyens de représenter des mécanismes permettant de modéliser les relations de parenté entre ... -
Évolution de familles de gènes par duplications et pertes : algorithmes pour la correction d’arbres bruités
(2012-03-01)Les gènes sont les parties du génome qui codent pour les protéines. Les gènes d’une ou plusieurs espèces peuvent être regroupés en "familles", en fonction de leur similarité de séquence. Cependant, pour connaître les relations fonctionnelles entre ces ... -
Évolution des génomes par mutations locales et globales : une approche d’alignement
(2017-03-28)Durant leur évolution, les génomes accumulent des mutations pouvant affecter d’un nucléotide à plusieurs gènes. Les modifications au niveau du nombre et de l’organisation des gènes dans les génomes sont dues à des mutations globales, telles que les ...