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Principes de l’évolution du réseau de l’homéostasie des protéines
(2019-05-02)
L’homéostasie cellulaire est la capacité d’une cellule à maintenir son équilibre et sa fonctionnalité. Une des causes de l’instabilité de cet équilibre est le stress. En effet, le stress provoque une accumulation des ...
Développement d’un outil bio-informatique pour l’annotation des associations entre gènes et métabolites basée sur les voies métaboliques
(2018-06-27)
La métabolomique permet l’étude de l’ensemble des métabolites (ex : lipides, sucres, acides aminés) par le biais d’une variété d’outils analytiques et de protocoles expérimentaux qui engendre des coûts importants. Actuellement ...
Séquençage d’exomes d’une cohorte de familles caucasiennes simplex dont les patients sont atteints du syndrome d’interruption de la tige hypophysaire
(2019-03-07)
Le syndrome d’interruption de la tige hypophysaire (PSIS) est un désordre rare qui affecte la
fonction du système endocrinien. Jusqu’à nos jours, l’imagerie par la résonance magnétique (IRM)
demeure la méthode la plus ...
Identification de caractéristiques communes et rares dans les ARN structurés dans la base de données Rfam
(2016-03-17)
Les ARN non codants (ARNnc) sont des transcrits d'ARN qui ne sont pas traduits en protéines et qui pourtant ont des fonctions clés et variées dans la cellule telles que la régulation des gènes, la transcription et la ...
Structural rules for the formation of backbone-backbone interactions between closely packed RNA double helices
(2013-12-10)
Les interactions entre les squelettes sucre-phosphate de nucléotides jouent un rôle important dans la stabilisation des structures tertiaires de larges molécules d’ARN. Elles sont régies par des règles particulières qui ...
Évolution à fine échelle des sites d'épissage des introns dans les gènes des oomycètes
(2016-03-17)
Les introns sont des portions de gènes transcrites dans l’ARN messager, mais retirées pendant l’épissage avant la synthèse des produits du gène. Chez les eucaryotes, on rencontre les introns splicéosomaux, qui sont retirés ...
Développement de méthodes d'assemblage de génomes de novo adaptées aux bactéries endosymbiotes
(2015-10-15)
Le but de ce projet était de développer des méthodes d'assemblage de novo dans le but d'assembler de petits génomes, principalement bactériens, à partir de données de séquençage de nouvelle-génération. Éventuellement, ces ...
Typage de la classe génotypique du gène PRDM9 à partir de données de séquençage de Nouvelle Génération
(2016-03-17)
Les positions des évènements de recombinaison s’agrègent ensemble, formant des hotspots déterminés en partie par la protéine à évolution rapide PRDM9. En particulier, ces positions de hotspots sont déterminées par le domaine ...
Étude des signatures géniques dans un contexte d’expériences de RNA- Seq
(2018-03-12)
Le principal intérêt des expériences de séquençage d’ARN (RNA-Seq) est qu’elles consti- tuent une vue d’ensemble sur les procédés géniques intrinsèques de la cellule. L’état malade différe de l’état sain de par ...
Évolution moléculaire : un modèle Markov-modulé pour les processus de substitution
(2014-05-20)
Les processus Markoviens continus en temps sont largement utilisés pour tenter d’expliquer l’évolution des séquences protéiques et nucléotidiques le long des phylogénies. Des modèles probabilistes reposant sur de telles ...