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Riboswitches : le cas des atténuateurs de la transcription du type terminateur/antiterminateur chez les bactéries
(2012-06-01)
Il est essentiel pour chaque organisme d’avoir la possibilité de réguler ses fonctions afin de permettre sa survie et d’améliorer sa capacité de se reproduire en divers habitats. Avec l’information disponible, il semble ...
Algorithmes pour la reconstruction de génomes ancestraux
(2012-09-04)
L’inférence de génomes ancestraux est une étape essentielle pour l’étude de l’évolution
des génomes. Connaissant les génomes d’espèces éteintes, on peut proposer des
mécanismes biologiques expliquant les divergences entre ...
The genetics of red blood cell density, a biomarker of clinical severity in sickle cell disease
(2017-05-01)
L’anémie falciforme est l’une des maladies du sang les plus répandues chez l’homme. Les complications liées à la maladie sont systémiques. Influant virtuellement tous les organes du corps, cette affection provoque des ...
Estimation des corrélations phylogénétiques entre paramètres d'évolution moléculaire et Traits d'histoire de vie
(2013-03-01)
Depuis quelques années, l'évolution moléculaire cherche à caractériser les variations et l'intensité de la sélection grâce au rapport entre taux de substitution synonyme et taux de substitution non-synonyme (dN/dS). Cette ...
Caractérisation du microDNome et sa modulation par le traitement anti-cancer
(2017-05-01)
Récemment, une nouvelle classe d'ADN circulaire extrachromosomique (eccDNA) appelée microADN a été identifiée dans des tissus humains et murins. Ces microADNs ont une longueur de 100 à 400 pb, sont dérivés de régions ...
An approach to improved microbial eukaryotic genome annotation
(2018-05-15)
Les nouvelles technologies de séquençage d’ADN ont accélérées la vitesse à laquelle les
données génomiques sont générées. Par contre, une fois séquencées et assemblées, un défi
continu est l'annotation structurelle précise ...
Méthodologie pour l’analyse de données de criblage : application à l'étude de la leucémie myéloïde aiguë
(2018-10-11)
Les expériences de criblage à haut débit (CHD) permettent d’évaluer l’efficacité de com- posés chimiques pour diverses conditions. L’analyse des données se fait en générant une courbe de type dose-réponse et en ...
Analyse de la corrélation conditionnelle dérivée de la coévolution d’un système de trois gènes par un modèle du maximum de vraisemblance
(2011-05-05)
Les gènes codant pour des protéines peuvent souvent être regroupés et intégrés en modules fonctionnels par rapport à un organelle. Ces modules peuvent avoir des composantes qui suivent une évolution corrélée pouvant être ...
Phylogénomique des Archées
(2011-10-06)
Les transferts horizontaux de gènes (THG) ont été démontrés pour jouer un rôle important dans l'évolution des procaryotes. Leur impact a été le sujet de débats intenses, ceux-ci allant même jusqu'à l'abandon de l'arbre des ...
Prédiction et visualisation de la réactivité chimique des ARN. Proposition d’un modèle basé sur la réactivité : des cycles minimaux et des sous-structures composées de ces cycles
(2019-03-07)
Mesurer la réactivité chimique d’un nucléotide d’une séquence d’ARN permet d’inférer sa conformation locale. L’interprétation la plus simple de la conformation locale d’un nucléotide est de le qualifier par le terme pairé ...