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Annotation des ARN non codants du génome de Candida albicans par méthode bioinformatique
(2009-07-09)
La bio-informatique est un champ pluridisciplinaire qui utilise la biologie,
l’informatique, la physique et les mathématiques pour résoudre des problèmes posés par la
biologie. L’une des thématiques de la bio-informatique ...
Analyse de motifs d'ARN
(2008-01-10)
Développement de méthodes d'assemblage de génomes de novo adaptées aux bactéries endosymbiotes
(2015-10-15)
Le but de ce projet était de développer des méthodes d'assemblage de novo dans le but d'assembler de petits génomes, principalement bactériens, à partir de données de séquençage de nouvelle-génération. Éventuellement, ces ...
Évolution à fine échelle des sites d'épissage des introns dans les gènes des oomycètes
(2016-03-17)
Les introns sont des portions de gènes transcrites dans l’ARN messager, mais retirées pendant l’épissage avant la synthèse des produits du gène. Chez les eucaryotes, on rencontre les introns splicéosomaux, qui sont retirés ...
Typage de la classe génotypique du gène PRDM9 à partir de données de séquençage de Nouvelle Génération
(2016-03-17)
Les positions des évènements de recombinaison s’agrègent ensemble, formant des hotspots déterminés en partie par la protéine à évolution rapide PRDM9. En particulier, ces positions de hotspots sont déterminées par le domaine ...
Évolution moléculaire : un modèle Markov-modulé pour les processus de substitution
(2014-05-20)
Les processus Markoviens continus en temps sont largement utilisés pour tenter d’expliquer l’évolution des séquences protéiques et nucléotidiques le long des phylogénies. Des modèles probabilistes reposant sur de telles ...
Développement d’une méthode bio-informatique permettant de relier les gènes aux métabolites
(2016-03-23)
L’objectif de ce projet était de faire le lien entre gènes et métabolites afin d’éventuellement proposer des métabolites à mesurer en lien avec la fonction de gènes. Plus particulièrement, nous nous sommes intéressés aux ...
Étude des signatures géniques dans un contexte d’expériences de RNA- Seq
(2018-03-12)
Le principal intérêt des expériences de séquençage d’ARN (RNA-Seq) est qu’elles consti- tuent une vue d’ensemble sur les procédés géniques intrinsèques de la cellule. L’état malade différe de l’état sain de par ...
Approche bio-informatique permettant de déterminer l'impact des mutations pathogènes de DNMT3A sur la spécification et la programmation de la lignée neuronale dans le syndrome de Tatton-Brown-Rahman
(2022-03-31)
Le syndrome de Tatton-Brown-Rahman (TBRS) est une maladie génétique rare caractérisée par une taille plus grande que la normale, une déficience intellectuelle et des traits faciaux dysmorphiques. Ce trouble est associé à ...