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dc.contributor.advisorHamel, Sylvie
dc.contributor.advisorSchmitzer, Andreea-Ruxandra
dc.contributor.authorMohaddes, Zia
dc.date.accessioned2011-03-17T16:21:19Z
dc.date.availableNO_RESTRICTIONen
dc.date.available2011-03-17T16:21:19Z
dc.date.issued2011-02-03
dc.date.submitted2010-08
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/1866/4767
dc.subjectProtein evolutionen
dc.subjecttoolsen
dc.subjectcomparison of toolsen
dc.subjectsequence based alignmentsen
dc.subjectstructure based alignmentsen
dc.subjectÉvolution des protéinesen
dc.subjectOutilsen
dc.subjectComparaison des outilsen
dc.subjectAlignements de la structureen
dc.subject.otherBiology - Bioinformatics / Biologie - Bio-informatique (UMI : 0715)en
dc.titleModeling protein evolution using secondary structuresen
dc.typeThèse ou mémoire / Thesis or Dissertation
etd.degree.disciplineBio-informatiqueen
etd.degree.grantorUniversité de Montréalfr
etd.degree.levelMaîtrise / Master'sen
etd.degree.nameM. Sc.en
dcterms.abstractL’évolution des protéines est un domaine important de la recherche en bioinformatique et catalyse l'intérêt de trouver des outils d'alignement qui peuvent être utilisés de manière fiable et modéliser avec précision l'évolution d'une famille de protéines. TM-Align (Zhang and Skolnick, 2005) est considéré comme l'outil idéal pour une telle tâche, en termes de rapidité et de précision. Par conséquent, dans cette étude, TM-Align a été utilisé comme point de référence pour faciliter la détection des autres outils d'alignement qui sont en mesure de préciser l'évolution des protéines. En parallèle, nous avons élargi l'actuel outil d'exploration de structures secondaires de protéines, Helix Explorer (Marrakchi, 2006), afin qu'il puisse également être utilisé comme un outil pour la modélisation de l'évolution des protéines.en
dcterms.abstractProtein evolution is an important field of research in bioinformatics and catalyzes the requirement of finding alignment tools that can be used to reliably and accurately model the evolution of a protein family. TM-Align (Zhang and Skolnick, 2005) is considered to be the ideal tool for such a task, in terms of both speed and accuracy. Therefore in this study, TM-Align has been used as a point of reference to facilitate the detection of other alignment tools that are able to accurately model protein evolution. In parallel, we expand the existing protein secondary structure explorer tool, Helix Explorer (Marrakchi, 2006), so that it can also be used as a tool to model protein evolution.en
dcterms.languageengen


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