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Épistasie en médecine évolutive
(2024-03-28)
La variabilité de la réponse aux médicaments entre les individus est en grande partie attribuable aux différences génétiques causées par des mutations génétiques. Ces mutations ont émergé au cours de l'évolution humaine ...
Modélisation des biais mutationnels et rôle de la sélection sur l’usage des codons
(2020-06-04)
L’acquisition de données génomiques ne cesse de croître, ainsi que l’appétit pour les interpréter. Mais déterminer les processus qui ont façonné l’évolution des séquences codantes (et leur importance relative) est un défi ...
Approches bio-informatiques protéome-centrées pour l’étude des phénotypes complexes
(2023-10-26)
Parmi les différents acteurs impliqués dans le dogme de la biologie moléculaire, les protéines sont des unités biologiques fonctionnelles contribuant à de nombreux processus biologiques. Dans la compréhension de la relation ...
Beyond hairballs: depicting complexity of a kinase-phosphatase network in the budding yeast
(2017-10-12)
Les kinases et les phosphatases (KP) représentent la plus grande famille des enzymes dans la cellule. Elles régulent les unes les autres ainsi que 60 % du protéome, formant des réseaux complexes kinase-phosphatase (KP-Net) ...
Multi-omics approaches to sickle cell disease heterogeneity
(2023-10-26)
La drépanocytose est une maladie causée par une seule mutation dans le gène de la bêta-globine. Les complications liées à la maladie se manifestent sur le plan génétique, épigénique, transcriptionnel, et métabolique. Les ...
Predicting biomolecular function from 3D dynamics : sequence-sensitive coarse-grained elastic network model coupled to machine learning
(2023-02-23)
La dynamique structurelle des biomolécules est intimement liée à leur fonction, mais très coûteuse à
étudier expériementalement. Pour cette raison, de nombreuses méthodologies computationnelles ont été
développées afin ...
Comprendre la fonction cellulaire par l’analyse du transcriptome : une approche bio-informatique
(2022-11-24)
Le système immunitaire permet la défense de l’organisme contre l’intrusion de nombreux pathogènes (ex : microbes, champignons, virus et bactéries). Il est composé de plusieurs populations cellulaires, provenant d’une même ...
Analyse multiomique pour l’identification de biomarqueurs prédictifs de la réponse aux vaccins
(2022-11-24)
Cette thèse traite de l’utilisation de données large échelle pour élucider les mécanismes de
réponse à un vaccin et identifier des biomarqueurs permettant de prédire une réponse
immunitaire protectrice induite par la ...
La génétique humaine pour l'étude de cibles pharmacologiques
(2021-10-21)
En étudiant les variations génétiques au sein d'une population, il est possible d'identifier des polymorphismes génétiques qui confèrent une protection naturelle contre la maladie. Si l'on parvient à comprendre le mécanisme ...