Parcourir Thèses et mémoires électroniques de l’Université de Montréal par directeur·trice de recherche "El-Mabrouk, Nadia"
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Algorithmes de construction et correction d'arbres de gènes par la réconciliation
(2016-09-28)Les gènes, qui servent à encoder les fonctions biologiques des êtres vivants, forment l'unité moléculaire de base de l'hérédité. Afin d'expliquer la diversité des espèces que l'on peut observer aujourd'hui, il est essentiel de comprendre comment ... -
Algorithmes pour la reconstruction de génomes ancestraux
(2012-09-04)L’inférence de génomes ancestraux est une étape essentielle pour l’étude de l’évolution des génomes. Connaissant les génomes d’espèces éteintes, on peut proposer des mécanismes biologiques expliquant les divergences entre les génomes des espèces ... -
Approches algorithmiques pour l’inférence d’histoires de duplication en tandem avec inversions et délétions pour des familles multigéniques
(2010-05-05)[Français] Une fraction importante des génomes eucaryotes est constituée de Gènes Répétés en Tandem (GRT). Un mécanisme fondamental dans l’évolution des GRT est la recombinaison inégale durant la méiose, entrainant la duplication locale (en tandem) de ... -
Assessing the robustness of genetic codes and genomes
(2020-12-16)Deux approches principales existent pour évaluer la robustesse des codes génétiques et des séquences de codage. L'approche statistique est basée sur des estimations empiriques de probabilité calculées à partir d'échantillons aléatoires de permutations ... -
Edit distance metrics for measuring dissimilarity between labeled gene trees
(2020-12-16)Les arbres phylogénétiques sont des instruments de biologie évolutive offrant de formidables moyens d'étude pour la génomique comparative. Ils fournissent des moyens de représenter des mécanismes permettant de modéliser les relations de parenté entre ... -
Étude de l’évolution des génomes par duplications, pertes et réarrangements
(2014-05-01)La duplication est un des évènements évolutifs les plus importants, car elle peut mener à la création de nouvelles fonctions géniques. Durant leur évolution, les génomes sont aussi affectés par des inversions, des translocations (incluant des fusions ... -
Évolution de familles de gènes par duplications et pertes : algorithmes pour la correction d’arbres bruités
(2012-03-01)Les gènes sont les parties du génome qui codent pour les protéines. Les gènes d’une ou plusieurs espèces peuvent être regroupés en "familles", en fonction de leur similarité de séquence. Cependant, pour connaître les relations fonctionnelles entre ces ... -
Évolution des génomes par mutations locales et globales : une approche d’alignement
(2017-03-28)Durant leur évolution, les génomes accumulent des mutations pouvant affecter d’un nucléotide à plusieurs gènes. Les modifications au niveau du nombre et de l’organisation des gènes dans les génomes sont dues à des mutations globales, telles que les ... -
Méthodes et algorithmes pour l’amélioration de l’inférence de l’histoire évolutive des génomes
(2019-03-07)Les phylogénies de gènes offrent un cadre idéal pour l’étude comparative des génomes. Non seulement elles incorporent l’évolution des espèces par spéciation, mais permettent aussi de capturer l’expansion et la contraction des familles de gènes par ...