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Identification des peptides du complexe majeur d’histocompatibilité de classe I par spectrométrie de masse
(2011-07-07)
L’immunité adaptive et la discrimination entre le soi et le non-soi chez les vertébrés à mâchoire reposent sur la présentation de peptides par les récepteurs d’histocompatibilité majeur de classe I. Les peptides antigéniques, ...
Développement d’outils pour l’analyse de données de ChIP-seq et l’identification des facteurs de transcription
(2011-12-01)
La méthode ChIP-seq est une technologie combinant la technique de chromatine immunoprecipitation
avec le séquençage haut-débit et permettant l’analyse in vivo des facteurs
de transcription à grande échelle. Le traitement ...
Comparaison des méthodes d'analyse de l'expression différentielle basée sur la dépendance des niveaux d'expression
(2011-11-03)
La technologie des microarrays demeure à ce jour un outil important pour la mesure de l'expression génique. Au-delà de la technologie elle-même, l'analyse des données provenant des microarrays constitue un problème statistique ...
Étude structurale conformationnelle des toxines de l’anthrax par cryo-microscopie et dynamique moléculaire
(2011-05-05)
Les toxines de l’anthrax font partie de la famille des toxines A-B dans laquelle la moitié B se fixe à la membrane de la cellule permettant par la suite la translocation de la moitié A. Dans le cas de l’anthrax, la moitié ...
Prédiction de boucles de régulation associant microARN et gènes régulés par le récepteur de l'acide rétinoïque dans le cancer du sein
(2011-11-03)
Le récepteur de l'acide rétinoïque RAR est une protéine de la superfamille des récepteurs nucléaires liant le ligand acide rétinoïque (AR). En présence de son ligand, RAR induit la transcription de ses gènes cibles alors ...
Modeling protein evolution using secondary structures
(2011-02-03)
L’évolution des protéines est un domaine important de la recherche en bioinformatique et catalyse l'intérêt de trouver des outils d'alignement qui peuvent être utilisés de manière fiable et modéliser avec précision l'évolution ...
Analyse de la corrélation conditionnelle dérivée de la coévolution d’un système de trois gènes par un modèle du maximum de vraisemblance
(2011-05-05)
Les gènes codant pour des protéines peuvent souvent être regroupés et intégrés en modules fonctionnels par rapport à un organelle. Ces modules peuvent avoir des composantes qui suivent une évolution corrélée pouvant être ...
Phylogénomique des Archées
(2011-10-06)
Les transferts horizontaux de gènes (THG) ont été démontrés pour jouer un rôle important dans l'évolution des procaryotes. Leur impact a été le sujet de débats intenses, ceux-ci allant même jusqu'à l'abandon de l'arbre des ...