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Identification des peptides du complexe majeur d’histocompatibilité de classe I par spectrométrie de masse
(2011-07-07)
L’immunité adaptive et la discrimination entre le soi et le non-soi chez les vertébrés à mâchoire reposent sur la présentation de peptides par les récepteurs d’histocompatibilité majeur de classe I. Les peptides antigéniques, ...
Développement d’outils pour l’analyse de données de ChIP-seq et l’identification des facteurs de transcription
(2011-12-01)
La méthode ChIP-seq est une technologie combinant la technique de chromatine immunoprecipitation
avec le séquençage haut-débit et permettant l’analyse in vivo des facteurs
de transcription à grande échelle. Le traitement ...
Comparaison des méthodes d'analyse de l'expression différentielle basée sur la dépendance des niveaux d'expression
(2011-11-03)
La technologie des microarrays demeure à ce jour un outil important pour la mesure de l'expression génique. Au-delà de la technologie elle-même, l'analyse des données provenant des microarrays constitue un problème statistique ...
La cartographie des sites de régulation génétique à partir de données de débalancement allélique
(2012-01-05)
En 1975, Wilson et King ont proposé que l'évolution opère non seulement via des
changements affectant la structure des protéines, mais aussi via des mutations qui
modifient la régulation génétique. L'étude des éléments ...
Étude structurale conformationnelle des toxines de l’anthrax par cryo-microscopie et dynamique moléculaire
(2011-05-05)
Les toxines de l’anthrax font partie de la famille des toxines A-B dans laquelle la moitié B se fixe à la membrane de la cellule permettant par la suite la translocation de la moitié A. Dans le cas de l’anthrax, la moitié ...
Prédiction de boucles de régulation associant microARN et gènes régulés par le récepteur de l'acide rétinoïque dans le cancer du sein
(2011-11-03)
Le récepteur de l'acide rétinoïque RAR est une protéine de la superfamille des récepteurs nucléaires liant le ligand acide rétinoïque (AR). En présence de son ligand, RAR induit la transcription de ses gènes cibles alors ...
Modeling protein evolution using secondary structures
(2011-02-03)
L’évolution des protéines est un domaine important de la recherche en bioinformatique et catalyse l'intérêt de trouver des outils d'alignement qui peuvent être utilisés de manière fiable et modéliser avec précision l'évolution ...
Classes Alléliques d’Haplotypes et Sélection Positive dans le Génome Humain
(2009-06-04)
L'identification de régions génomiques cibles de la sélection naturelle positive permet de mieux comprendre notre passé évolutif et de trouver des variants génétiques fonctionnels importants. Puisque la fréquence des allèles ...
Représentation et recherche de motifs cycliques et structuraux d’ARN connus dans les structures secondaires
(2009-10-08)
L'acide désoxyribonucléique (ADN) et l'acide ribonucléique (ARN) sont des polymères de nucléotides essentiels à la cellule. À l'inverse de l'ADN qui sert principalement à stocker l'information génétique, les ARN sont ...
Performances de la puce exon et son application dans l’analyse de l’épissage alternatif associé à la métastase du cancer de sein
(2009-11-05)
Nous montrons l’utilisation de la puce exon d’Affymetrix pour l’analyse simultanée de l’expression des gènes et de la variation d’isoformes. Nous avons utilisé les échantillons d’ARN du cerveau et des tissus de référence ...