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A phylogenomics approach to resolving fungal evolution, and phylogenetic method development
(2010-08-05)
Bien que les champignons soient régulièrement utilisés comme modèle d'étude des systèmes eucaryotes, leurs relations phylogénétiques soulèvent encore des questions controversées. Parmi celles-ci, la classification des ...
Impact des variants génétiques sur la réponse immunitaire des populations humaines
(2018-03-12)
Les mécanismes impliqués dans les variations de susceptibilité aux infections bactériennes entre individus et populations demeurent méconnus. Durant mon doctorat, j’ai mis à jour l’existence de profondes différences dans ...
Novel bioinformatics programs for taxonomical classification and functional analysis of the whole genome sequencing data of arbuscular mycorrhizal fungi
(2019-03-07)
Résumé
[TITRE] Classification taxonomique et analyse fonctionnelle spécifique àla position des séquences génomique des champignons mycorhiziens arbusculaires et les microorganismes qui leurs sont associés [PROBLÉMATIQUE ...
Une nouvelle approche computationnelle pour la découverte des sites de fixation de facteurs de transcription à l’ADN, adaptée aux données de ChIP-chip et de ChIP-séquençage
(2014-03-03)
Les facteurs de transcription sont des protéines spécialisées qui jouent un rôle important dans différents processus biologiques tel que la différenciation, le cycle cellulaire et la tumorigenèse. Ils régulent la transcription ...
Méthodes et algorithmes pour l’amélioration de l’inférence de l’histoire évolutive des génomes
(2019-03-07)
Les phylogénies de gènes offrent un cadre idéal pour l’étude comparative des génomes.
Non seulement elles incorporent l’évolution des espèces par spéciation, mais permettent aussi
de capturer l’expansion et la contraction ...
Approches bio-informatiques appliquées aux technologies émergentes en génomique
(2014-05-01)
Les études génétiques, telles que les études de liaison ou d’association, ont permis d’acquérir une plus grande connaissance sur l’étiologie de plusieurs maladies affectant les populations humaines. Même si une dizaine de ...
Genetic determinants of clinical heterogeneity in sickle cell disease
(2014-09-22)
L’anémie falciforme est une maladie monogénique causée par une mutation dans le locus de la β-globine. Malgré le fait que l’anémie falciforme soit une maladie monogénique, cette maladie présente une grande hétérogénéité ...
Improving anti-cancer therapies through a better identification and characterization of non-canonical MHC-I associated peptides
(2023-08-07)
Increasing evidence of non-canonical protein translation has sparked interest in their identification and characterization for use in immunotherapy. In addition, recent studies on the repertoire of major histocompatibility ...