Browsing Faculté de médecine – Thèses et mémoires by Advisor "Major, François"
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Analyse de motifs d'ARN
(2008-01-10) -
Caractérisation systématique des motifs de régulation en cis à l’échelle transcriptomique et liens avec la localisation des ARN
(2020-12-03)La localisation subcellulaire de l’ARN permet un déploiement prompt et spatialement restreint autant des activités protéiques que des ARN noncodant. Le trafic d’ARN est dirigé par des éléments de séquences (sous-séquences primaires, structures secondaires), ... -
Comprendre la fonction cellulaire par l’analyse du transcriptome : une approche bio-informatique
(2022-11-24)Le système immunitaire permet la défense de l’organisme contre l’intrusion de nombreux pathogènes (ex : microbes, champignons, virus et bactéries). Il est composé de plusieurs populations cellulaires, provenant d’une même cellule souche multipotente, ... -
Conception de microARNs pour attenuer l'expression de genes
(2009-01-12)Les microARNs appartiennent à la famille des petits ARNs non-codants et agissent comme inhibiteurs des ARN messagers et/ou de leurs produits protéiques. Les mi- croARNs sont différents des petits ARNs interférants (siARN) car ils atténuent l’ex- pression ... -
Dissecting the effects of tumor microenvironment factors on cancer cells to reveal novel targets for multi-targeting RNA-based therapeutics
(2023-05-25)Il devient de plus en plus clair que pour traiter efficacement les tumeurs solides, nous devons également nous intéresser au microenvironnement tumoral. Physiologiquement, les zones intratumorales peuvent présenter une disponibilité anormale en nutriments, ... -
Étude de la signature dynamique de transcrits primaires impliquée dans la maturation des microARN
(2017-03-30)Les microARN (miARN) sont des petits ARN non-codants pour des protéines qui permettent d’inhiber la traduction d’ARN messagers. Pour obtenir un miARN, un gène de miARN passe à travers une voie de maturation dans laquelle il sera coupé à deux reprises ... -
Étude structurale conformationnelle des toxines de l’anthrax par cryo-microscopie et dynamique moléculaire
(2011-05-05)Les toxines de l’anthrax font partie de la famille des toxines A-B dans laquelle la moitié B se fixe à la membrane de la cellule permettant par la suite la translocation de la moitié A. Dans le cas de l’anthrax, la moitié B est représentée par le ... -
Identification de caractéristiques communes et rares dans les ARN structurés dans la base de données Rfam
(2016-03-17)Les ARN non codants (ARNnc) sont des transcrits d'ARN qui ne sont pas traduits en protéines et qui pourtant ont des fonctions clés et variées dans la cellule telles que la régulation des gènes, la transcription et la traduction. Parmi les nombreuses ... -
Identification in silico d’éléments de réponse de récepteurs nucléaires impliqués dans le cancer du sein
(2009-01-12)La croissance de deux tiers des tumeurs mammaires dépend des œstrogènes. Le réseau de gènes responsable de propager les signaux prolifératifs des œstrogènes est encore mal connu. Des micropuces d’ADN de cellules de carcinome mammaire MCF7 traitées à ... -
Modélisation de réseaux d'interactions des microARN et analyse et validation expérimentale de leurs boucles minimales avec des facteurs de transcription
(2013-08-02)Les microARN (miARN) sont de petits ARN non-codants qui répriment la traduction de leurs gènes cibles par hybridation à leur ARN messager (ARNm). L'identification de cibles biologiquement actives de miARN est cruciale afin de mieux comprendre leurs ... -
Nucleotide Complementarity Features in the Design of Effective Artificial miRNAs
(2019-03-07)L'importance du miARN dans la régulation des gènes a bien été établie. Cependant, le mécanisme précis du processus de reconnaissance des cibles n'est toujours pas complètement compris. Parmi les facteurs connus, la complémentarité en nucléotides, ... -
Predicting biomolecular function from 3D dynamics : sequence-sensitive coarse-grained elastic network model coupled to machine learning
(2023-02-23)La dynamique structurelle des biomolécules est intimement liée à leur fonction, mais très coûteuse à étudier expériementalement. Pour cette raison, de nombreuses méthodologies computationnelles ont été développées afin de simuler la dynamique ... -
Prédiction de boucles de régulation associant microARN et gènes régulés par le récepteur de l'acide rétinoïque dans le cancer du sein
(2011-11-03)Le récepteur de l'acide rétinoïque RAR est une protéine de la superfamille des récepteurs nucléaires liant le ligand acide rétinoïque (AR). En présence de son ligand, RAR induit la transcription de ses gènes cibles alors qu'en son absence la transcription ... -
Prédiction et visualisation de la réactivité chimique des ARN. Proposition d’un modèle basé sur la réactivité : des cycles minimaux et des sous-structures composées de ces cycles
(2019-03-07)Mesurer la réactivité chimique d’un nucléotide d’une séquence d’ARN permet d’inférer sa conformation locale. L’interprétation la plus simple de la conformation locale d’un nucléotide est de le qualifier par le terme pairé ou non pairé. Bien qu’ils ... -
Représentation et recherche de motifs cycliques et structuraux d’ARN connus dans les structures secondaires
(2009-10-08)L'acide désoxyribonucléique (ADN) et l'acide ribonucléique (ARN) sont des polymères de nucléotides essentiels à la cellule. À l'inverse de l'ADN qui sert principalement à stocker l'information génétique, les ARN sont impliqués dans plusieurs processus ... -
Riboswitches : le cas des atténuateurs de la transcription du type terminateur/antiterminateur chez les bactéries
(2012-06-01)Il est essentiel pour chaque organisme d’avoir la possibilité de réguler ses fonctions afin de permettre sa survie et d’améliorer sa capacité de se reproduire en divers habitats. Avec l’information disponible, il semble que les organismes consacrent ...