Perturbation des profils épigénétiques suite à une perte temporaire du maintien de la méthylation de l’ADN dans les cellules embryonnaires
Thèse ou mémoire
2018-08 (octroi du grade: 2019-03-07)
Auteur·e·s
Cycle d'études
MaîtriseProgramme
BiochimieMots-clés
Résumé·s
Chez l’embryon précoce, une vague de reprogrammation majeure survient et permet de
réinitialiser les profils de méthylation d’ADN de l’ensemble du génome. Lors de cette
reprogrammation, les régions différentiellement méthylées (DMRs) (i.e., gènes
empreintes) doivent toutefois être protégées de la déméthylation par une action continue
de DNMT1 (Méthyltransférase d’ADN 1) pour assurer le développement adéquat de
l’épigénome du fœtus. Sachant que l’induction d’une perte temporaire d’expression de
Dnmt1 dans un modèle de cellules souches embryonnaires de souris entraîne la perte
permanente des patrons de méthylation d’ADN aux régions DMRs et DMR-like, mon
projet de recherche vise à comprendre pourquoi ces régions sont incapables de retrouver
leurs patrons de méthylation d’ADN initiaux. Notre hypothèse est qu’une adaptation
épigénétique (i.e. réarrangement erroné de certaines modifications d’histones) survient aux
régions régulatrices de l’expression des gènes (promoteurs et enhancers) et empêche
directement ou indirectement le retour au paysage épigénétique initial aux régions
affectées. L’objectif du projet est donc de précisément définir comment la perte temporaire
de Dnmt1 remodèle le paysage épigénétique aux régions promotrices (H3K4me3,
H3K27me3, H3K27ac, H3K4me1, H3K9me3, méthylation d’ADN) et comment les
adaptations épigénétiques sont associées avec des changements de l’expression des gènes
(ex : gènes des régions DMRs et DMRs-like). In early embryos, a major reprogramming wave occurs and permits to reset DNA
methylation profiles genome-wide. During the reprogramming wave, differentially
methylated regions (DMRs) (imprinted genes) must be protected from demethylation by
the continuous action of DNMT1 (DNA Methyltransferase 1) to ensure the proper
development of the foetal epigenome. As the induction of a temporary loss of Dnmt1
expression in a mouse embryonic stem cell model leads to permanent losses of DNA
methylation at DMR and DMR-like regions, my project aims to understand why those
regions are unable to re-establish their initial DNA methylation patterns. Our hypothesis is
that an epigenetic adaptation (erroneous rearrangement of certain histone modifications)
occurs at regulatory regions controlling gene expression (promoters and enhancers) and
impede directly or indirectly the affected regions to return to their initial epigenetic
landscape. The goal of this project is thus to define how the temporary loss of Dnmt1
remodels the epigenetic landscape at promoter regions (H3K4me3, H3K27me3, H3K27ac,
H3K4me1, H3K9me3, DNA methylation) and how the epigenetic adaptations are
associated with changes in gene expression (ex: genes in DMR and DMR-like regions).
Collections
Ce document diffusé sur Papyrus est la propriété exclusive des titulaires des droits d'auteur et est protégé par la Loi sur le droit d'auteur (L.R.C. (1985), ch. C-42). Il peut être utilisé dans le cadre d'une utilisation équitable et non commerciale, à des fins d'étude privée ou de recherche, de critique ou de compte-rendu comme le prévoit la Loi. Pour toute autre utilisation, une autorisation écrite des titulaires des droits d'auteur sera nécessaire.