Dynamique de la variation génétique et épigénétique chez un vertébré kleptogène

Abstract

La variation phénotypique est essentielle à la persistance des organismes dans le temps ainsi qu’à la colonisation de nouveaux habitats. Les principales sources de variation phénotypique sont la génétique et l'épigénétique. L'épigénétique a été proposé comme un atout important pour les organismes asexués pour compenser le manque de diversité génétique. L'objectif de cette étude est d'évaluer si l’absence de variation génétique est compensée par l'épigénétique en comparant les profils de méthylation d’individus gynogènes et kleptogènes des hybrides de salamandre à points bleus. Les individus échantillonnés s’organisent en cinq groupes génétiquement différenciés, provenant du même haplome paternel A. jeffersonianum. Deux des cinq groupes sont exclusivement gynogènes, pour des raisons écologiques ou génomiques. Les trois autres groupes sont formés d’individus parfois kleptogènes, car ils présentent une variation génétique plus élevée au sein d’un site qu’entre les sites, en plus de porter des allèles très divergents par rapport à la distribution globale des allèles hybrides, trouvés en haute fréquence dans les populations sympatriques de A. laterale. Les patrons épigénétiques sont variables et distincts entre les cinq groupes génétiques. Les groupes gynogènes sont les seuls à présenter un effet environnemental significatif sur leurs patrons épigénétiques, suggérant que ces individus clonaux doivent être en mesure de maximiser leur potentiel de variation épigénétique pour faire face à des variations environnementales.

Phenotypic variation is critical to the persistence of organisms over time and the colonization of new habitats. The main consistent sources of phenotypic variation are genetics and epigenetics. Epigenetics was proposed as a valuable asset for asexual organisms to compensate or to complete genetic diversity. The objective of this study is to assess whether lack of genetic variation is compensated by epigenetics by comparing methylation patterns of gynogen and kleptogen individuals of the blue-spotted salamander hybrids. Individuals sampled clustered in five genetically differentiated groups, derived from the very same paternal A. jeffersonianum haplome. Two out of the five groups are exclusively gynogenetic, for either ecological or genomic factors. The other three groups occasionally formed kleptogen individuals, since they display a higher genetic variation within sites than among sites, in addition of displaying highly divergent alleles found in high frequency in the sympatric A. laterale populations. Epigenetic patterns are variable and distinct among the five genetic groups. Gynogenetic groups are the only one to display a significant environmental effect on their epigenetic pattern, suggesting clonal individuals must be able to make the most from their epigenetic variation potential to deal with environmental variations.