Syndrome du QT long: étude clinique à l’Institut Cardiologique de Montréal et recherche de nouvelles variantes causales par séquençage à haut débit

Abstract

Le syndrome du QT long congénital (LQTS) est une canalopathie génétique, à l’origine de syncopes et mort subite. Le dépistage génétique identifie des variantes génétiques dans 50-70% des cas, suggérant l’implication d’autres gènes. Nous avons recueilli les caractéristiques des patients avec un LQTS à l’ICM, et recruté 12 patients avec un génotype négatif pour le LQTS pour un séquençage à haut débit des exons afin d’identifier de nouvelles variantes causales. Nous avons développé une approche analytique par étapes : (1) les gènes connus du, (2) les gènes dans des loci identifiés par des études d’association sur le QT, et (3) les gènes montrant la même variante chez plusieurs patients. L’analyse génétique a identifié de nouvelles variantes dans: (1) KCNJ2, ANK2 et AKAP9, et (2) dans NOS1AP. (3) Deux patientes avec des phénotypes semblables présentent la même variante homozygote dans TECRL, un nouveau gène candidat dont le rôle est inconnu.

Long QT syndrome (LQTS) is a channelopathy, causing syncope and sudden death. Genetic testing of individuals identifies genetic variants in up to 50-70% of cases, suggesting that additional genes may be involved. We have identified 50 patients with a diagnosis of LQTS at MHI, and recruited 12 patients reported negative for clinical testing of mutations in LQTS for a whole-exome next generation DNA sequencing approach in order to identify new variants and candidate genes. We have developed a stepwise analytic approach that focuses on (1) the known LQTS genes, (2) the genes in loci identified in genome-wide association studies of QT-interval, and (3) the loci showing variants across multiple patients. Our approach identified new variants in (1) KCNJ2, ANK2 and AKAP9, and (2) in NOS1AP. We identify 2 patients with a very similar phenotype with a homozygous variant in TECRL, an novel candidate gene with an unknown role in LQTS.