Browsing Thèses et mémoires électroniques de l’Université de Montréal by Discipline "Bio-informatique"
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Adaptation de la levure à la suite des perturbations du mécanisme de contrôle de qualité de l'ARN
(2020-03-18)The life-cycle of RNA is determined by several processing steps, which allow the cell to export and translate a coding transcript. The cell has developed an astonishingly complex mechanism to ensure the integrity of RNA processing steps. The quality ... -
Algorithmes pour la reconstruction de génomes ancestraux
(2012-09-04)L’inférence de génomes ancestraux est une étape essentielle pour l’étude de l’évolution des génomes. Connaissant les génomes d’espèces éteintes, on peut proposer des mécanismes biologiques expliquant les divergences entre les génomes des espèces ... -
Amélioration de l'exactitude de l'inférence phylogénomique
(2011-10-06)L’explosion du nombre de séquences permet à la phylogénomique, c’est-à-dire l’étude des liens de parenté entre espèces à partir de grands alignements multi-gènes, de prendre son essor. C’est incontestablement un moyen de pallier aux erreurs stochastiques ... -
Analyse de la corrélation conditionnelle dérivée de la coévolution d’un système de trois gènes par un modèle du maximum de vraisemblance
(2011-05-05)Les gènes codant pour des protéines peuvent souvent être regroupés et intégrés en modules fonctionnels par rapport à un organelle. Ces modules peuvent avoir des composantes qui suivent une évolution corrélée pouvant être conditionnelle à un phénotype ... -
Analyse de motifs d'ARN
(2008-01-10) -
An analysis of translation heterogeneity in ribosome profiling data
(2020-06-04)Les protéines sont responsables de pratiquement toutes les fonctions performées au sein du corps cellulaire et de ses alentours. Le contrôle de l’expression génique détermine l’abondance, la localisation et le moment de la production de protéines dans ... -
Annotation des ARN non codants du génome de Candida albicans par méthode bioinformatique
(2009-07-09)La bio-informatique est un champ pluridisciplinaire qui utilise la biologie, l’informatique, la physique et les mathématiques pour résoudre des problèmes posés par la biologie. L’une des thématiques de la bio-informatique est l’analyse des ... -
An approach to improved microbial eukaryotic genome annotation
(2018-05-15)Les nouvelles technologies de séquençage d’ADN ont accélérées la vitesse à laquelle les données génomiques sont générées. Par contre, une fois séquencées et assemblées, un défi continu est l'annotation structurelle précise de ces nouvelles séquences ... -
Approches algorithmiques pour l’inférence d’histoires de duplication en tandem avec inversions et délétions pour des familles multigéniques
(2010-05-05)[Français] Une fraction importante des génomes eucaryotes est constituée de Gènes Répétés en Tandem (GRT). Un mécanisme fondamental dans l’évolution des GRT est la recombinaison inégale durant la méiose, entrainant la duplication locale (en tandem) de ... -
Approches bio-informatiques appliquées aux technologies émergentes en génomique
(2014-05-01)Les études génétiques, telles que les études de liaison ou d’association, ont permis d’acquérir une plus grande connaissance sur l’étiologie de plusieurs maladies affectant les populations humaines. Même si une dizaine de milliers d’études génétiques ... -
Bayesian codon models for detecting convergent molecular adaptation
(2018-10-11)Modéliser le jeu combiné de la mutation et de la sélection au niveau moléculaire représente un des objectifs majeurs des sciences de l’évolution. L’acquisition massive de séquences génétiques au cours des dernières années a fourni un matériel abondant ... -
Beyond hairballs: depicting complexity of a kinase-phosphatase network in the budding yeast
(2017-10-12)Les kinases et les phosphatases (KP) représentent la plus grande famille des enzymes dans la cellule. Elles régulent les unes les autres ainsi que 60 % du protéome, formant des réseaux complexes kinase-phosphatase (KP-Net) jouant un rôle essentiel dans ... -
Caractérisation du microDNome et sa modulation par le traitement anti-cancer
(2017-05-01)Récemment, une nouvelle classe d'ADN circulaire extrachromosomique (eccDNA) appelée microADN a été identifiée dans des tissus humains et murins. Ces microADNs ont une longueur de 100 à 400 pb, sont dérivés de régions génomiques non répétitives uniques ... -
Caractérisation systématique des motifs de régulation en cis à l’échelle transcriptomique et liens avec la localisation des ARN
(2020-12-03)La localisation subcellulaire de l’ARN permet un déploiement prompt et spatialement restreint autant des activités protéiques que des ARN noncodant. Le trafic d’ARN est dirigé par des éléments de séquences (sous-séquences primaires, structures secondaires), ... -
La cartographie des sites de régulation génétique à partir de données de débalancement allélique
(2012-01-05)En 1975, Wilson et King ont proposé que l'évolution opère non seulement via des changements affectant la structure des protéines, mais aussi via des mutations qui modifient la régulation génétique. L'étude des éléments régulateurs de l'expression génétique ... -
Classes Alléliques d’Haplotypes et Sélection Positive dans le Génome Humain
(2009-06-04)L'identification de régions génomiques cibles de la sélection naturelle positive permet de mieux comprendre notre passé évolutif et de trouver des variants génétiques fonctionnels importants. Puisque la fréquence des allèles sélectionnés augmente dans ... -
Comparaison des méthodes d'analyse de l'expression différentielle basée sur la dépendance des niveaux d'expression
(2011-11-03)La technologie des microarrays demeure à ce jour un outil important pour la mesure de l'expression génique. Au-delà de la technologie elle-même, l'analyse des données provenant des microarrays constitue un problème statistique complexe, ce qui explique ...
