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Phylogénomique des Archées
(2011-10-06)
Les transferts horizontaux de gènes (THG) ont été démontrés pour jouer un rôle important dans l'évolution des procaryotes. Leur impact a été le sujet de débats intenses, ceux-ci allant même jusqu'à l'abandon de l'arbre des ...
Analyse de la corrélation conditionnelle dérivée de la coévolution d’un système de trois gènes par un modèle du maximum de vraisemblance
(2011-05-05)
Les gènes codant pour des protéines peuvent souvent être regroupés et intégrés en modules fonctionnels par rapport à un organelle. Ces modules peuvent avoir des composantes qui suivent une évolution corrélée pouvant être ...
Développement d’un outil bio-informatique pour l’annotation des associations entre gènes et métabolites basée sur les voies métaboliques
(2018-06-27)
La métabolomique permet l’étude de l’ensemble des métabolites (ex : lipides, sucres, acides aminés) par le biais d’une variété d’outils analytiques et de protocoles expérimentaux qui engendre des coûts importants. Actuellement ...
Principes de l’évolution du réseau de l’homéostasie des protéines
(2019-05-02)
L’homéostasie cellulaire est la capacité d’une cellule à maintenir son équilibre et sa fonctionnalité. Une des causes de l’instabilité de cet équilibre est le stress. En effet, le stress provoque une accumulation des ...
Séquençage d’exomes d’une cohorte de familles caucasiennes simplex dont les patients sont atteints du syndrome d’interruption de la tige hypophysaire
(2019-03-07)
Le syndrome d’interruption de la tige hypophysaire (PSIS) est un désordre rare qui affecte la
fonction du système endocrinien. Jusqu’à nos jours, l’imagerie par la résonance magnétique (IRM)
demeure la méthode la plus ...
Prédiction et visualisation de la réactivité chimique des ARN. Proposition d’un modèle basé sur la réactivité : des cycles minimaux et des sous-structures composées de ces cycles
(2019-03-07)
Mesurer la réactivité chimique d’un nucléotide d’une séquence d’ARN permet d’inférer sa conformation locale. L’interprétation la plus simple de la conformation locale d’un nucléotide est de le qualifier par le terme pairé ...
Identification de caractéristiques communes et rares dans les ARN structurés dans la base de données Rfam
(2016-03-17)
Les ARN non codants (ARNnc) sont des transcrits d'ARN qui ne sont pas traduits en protéines et qui pourtant ont des fonctions clés et variées dans la cellule telles que la régulation des gènes, la transcription et la ...
Riboswitches : le cas des atténuateurs de la transcription du type terminateur/antiterminateur chez les bactéries
(2012-06-01)
Il est essentiel pour chaque organisme d’avoir la possibilité de réguler ses fonctions afin de permettre sa survie et d’améliorer sa capacité de se reproduire en divers habitats. Avec l’information disponible, il semble ...
Une correction à l’échelle et progressive des données Hi-C révèlent des principes fondamentaux de l’organisation tridimensionnelle et fonctionnelle du génome
(2017-03-30)
Au cours des dernières années, de nouvelles évidences semblent indiquer que, tout autant que sa séquence, l’organisation d’un génome dans l’espace et le temps est importante pour comprendre la fonction de celui-ci. ...
Identification des peptides du complexe majeur d’histocompatibilité de classe I par spectrométrie de masse
(2011-07-07)
L’immunité adaptive et la discrimination entre le soi et le non-soi chez les vertébrés à mâchoire reposent sur la présentation de peptides par les récepteurs d’histocompatibilité majeur de classe I. Les peptides antigéniques, ...