Étude mécanistique computationnelle des réactions d’amination catalysées par des dimères de rhodium
Thesis or Dissertation
2020-01 (degree granted: 2020-12-16)
Author(s)
Level
DoctoralDiscipline
ChimieKeywords
- Dimères de rhodium
- N-Mésyloxycarbamates
- DFT
- Amination de Liens C-H
- PBE
- Aziridination Catalytique
- MECP
- Dimères de Rhodium Chiraux
- Espèces Nitrènes de Rhodium
- Complexe Nitrénoïde
- Sulfimidation
- Bis(DMAP)CH2Cl2
- Réactivité via Différents États de Spin
- Rhodium Dimers
- N-Mesyloxycarbamates
- Chiral Rhodium Dimer
- Rhodium Nitrene Species
- Nitrenoid Complex
- C-H Bond Amination
- Catalytic Aziridination
- Multi-States Reactivity
- Diastereoselective Aziridination
- Chemistry - Organic / Chimie organique (UMI : 0490)
Abstract(s)
Catalytic amination reactions are a powerful tool in organic synthesis. They aim to introduce nitrogen atom to alkane, alkene or thioether moieties, giving rise to amine products that have various medical and industrial applications. The Lebel group has developed catalytic amination reactions in the presence of rhodium dimers using N-sulfonyloxycarbamates as nitrene precursors. In the presence of a base, N-sulfonyloxycarbamates presumably afforded rhodium nitrenes which underwent C-H insertions, C=C additions or reactions with the sulfur atom of thioethers resulting in acyclic and cyclic carbamates, aziridines and sulfilimines respectively. In addition, good diastereoselectivities were observed in the presence of a chiral N-sulfonyloxycarbamate reagent and a chiral rhodium dimer for all three reactions.
In this dissertation, we are interested in the mechanistic aspects of these amination reactions. Given the absence of experimental proofs of in-situ generated rhodium nitrene species, playing the role of the amination agent, nor of its precomplex, the rhodium nitrenoid, the different amination reactions mechanisms remain uncertain. Our approach is based on the scan of the potential energy surfaces of different mechanistic paths, for each of the amination reactions, well established on the experimental level, by resorting to the Functional Theory of Density (DFT).
The Ernzerhof research group is expert on the development of exchange-correlation functionals, therefore relevant strict criteria have been considered when choosing and validating the theoretical model used during the mechanistic studies. The correlation exchange functional developed by Perdew-Burke-Ernzerhof (PBE) was established as the best to study reactions involving rhodium dimers where the electronic correlation is strong. We studied the formation and reactivity of rhodium nitrene species considering their two lower energy spin states. Singlet rhodium nitrenes appeared to be the most reactive intermediates for the C-H amination reaction. In addition, singlet rhodium nitrenes were shown responsible for the formation of secondary products such as carbonyls and primary carbamates derived from the corresponding N-mesyloxycarbamates. In sharp contrast, in the aziridination reaction, both singlet and triplet rhodium nitrene species acted as aminating agents in a process involving an intersystem spin crossover. To further rationalize the asymmetric induction of catalytic aziridination reactions, we have undertaken the calculation of the diastereoselectivity ratios in the presence of the chiral catalyst Rh2[(S)-nttl]4. An exhaustive study was performed and it revealed that the asymmetric induction was due to a reactive conformation of rhodium nitrene species in which the ligand adopts C4 symmetry.
Up to now, no mechanistic study involving DFT calculations have been reported in the literature for the amination of thioethers, no matter what catalytic system is used. To study catalytic sulfimidation reactions, we calculated the different mechanistic paths of rhodium catalyzed thioanisole imidation with and without DMAP and bis(DMAP)CH2Cl2 additives. The study showed a 'classical' insertion mechanism of rhodium nitrene species into the thioether in absence of bis(DMAP)CH2Cl2. In the presence of the latter, the mechanism diverged to a thioether insertion/salt (bis(DMAP)CH2Cl-OMs) elimination reaction where the rhodium nitrenoid complex was, henceforth, the imidation reagent. Les réactions d’amination catalytiques sont un outil très efficace en synthèse organique.
Elles consistent à introduire un azote sur différents composés organiques, permettant de
synthétiser des produits aminés qui peuvent être utilisés pour différentes applications
médicales et industrielles. Le groupe de recherche du Pr Lebel a développé des réactions
d’amination faisant appel aux dimères de rhodium comme catalyseurs et en utilisant les Nsulfonyloxycarbamates,
comme précurseurs de nitrènes métalliques. En effet, en présence
d’une base, les N-sulfonyloxycarbamates forment possiblement un intermédiaire de type
nitrène de rhodium qui peuvent s’insérer dans un lien C-H, s’additionner sur un lien C=C ou
réagir avec un atome de soufre d’un thioéther. On peut ainsi préparer des carbamates cycliques
et acycliques, des aziridines et des sulfilimines respectivement. Dans le cas où les réactions
d’amination sont catalysées par des dimères de rhodium chiraux, on obtient de bonnes
diastéréosélectivités en présence d’un réactif N-sulfonyloxycarbamate chiral.
Dans cette dissertation, nous nous sommes intéressés aux aspects mécanistiques de ces
réactions d’amination. À défaut de preuves expérimentales solides pour prouver la génération
in-situ des espèces nitrènes de rhodium, lesquelles sont les agents d’amination clés, ni de celle
du pré-complexe, nitrénoïde de rhodium, des incertitudes subsistaient toujours concernant les
mécanismes des différentes réactions d’amination. Notre approche se base sur l’étude des
surfaces d’énergies potentielles de différents chemins mécanistiques possibles pour chacune
des réactions d’amination, bien établie sur le plan expérimental, en faisant recours à la Théorie
des Fonctionnelles de la Densité (DFT).
Le groupe de recherche du Pr Ernzerhof est expert dans le développement des
fonctionnelles d’échange-corrélation. Pour ce, des critères strictes et pertinents ont été pris en
compte lors du choix et de la validation du modèle théorique utilisé dans ces études
mécanistiques. La fonctionnelle d’échange corrélation développée par Perdew–Burke–
Ernzerhof (PBE) s’est révélé être la meilleure pour décrire ces systèmes réactionnels faisant
intervenir les dimères de rhodium dont la corrélation électronique est forte. À l’aide de cette
fonctionnelle pure, nous avons étudié la formation et la réactivité des espèces nitrènes de
rhodium en fonction de leurs deux états de spin de plus basse énergie. Les nitrènes de rhodium
singulet se sont révélés être les intermédiaires les plus réactifs dans l`amination de liens C-H.
De plus, les nitrènes de rhodium à l’état singulet sont responsables de la formation des
produits secondaires tels que les carbonyles et les carbamates primaires dérivés des Nmésyloxycarbamates
correspondants. Dans la réaction d’aziridination, les espèces nitrènes de
rhodium à l’état singulet et triplet peuvent toutes les deux agir comme agents d'amination et
les processus font intervenir un croisement intersystème de spin. Afin de rationaliser
l’induction asymétrique des réactions d’aziridination catalytiques, nous avons entrepris le
calcul des ratios de diastéréosélectivités en présence du catalyseur chiral Rh2[(S)-nttl]4.
L’étude exhaustive de cette réaction a permis de déterminer que l’induction asymétrique
provient d’une conformation réactive de l’espèce nitrène de rhodium de symétrie C4.
Aucune étude mécanistique s’appuyant sur la chimie computationnelle n’a été rapportée
dans la littérature pour la réaction d’amination de thioéthers et ce peu importe le système
catalytique. Afin d’étudier les réactions de sulfimidation catalytiques, nous avons calculé les
différents chemins mécanistiques de l’imidation du thioanisole catalysée par un complexe de
rhodium avec et sans les additifs DMAP et bis(DMAP)CH2Cl2. L’étude montre que le
mécanisme procède via une insertion ‘classique’ des espèces nitrènes de rhodium dans le
thioéther en absence de bis(DMAP)CH2Cl2. En présence de ce dernier, le mécanisme diverge
vers une réaction d’insertion du thioéther/élimination d’un sel (bis(DMAP)CH2Cl-OMs) où le
complexe nitrénoïde de rhodium devient, désormais, l’agent d’imidation.
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