Étude cinétique du mécanisme de transfert de proton dans une réaction acidobasique en milieu aqueux
Thesis or Dissertation
2021-10 (degree granted: 2021-11-23)
Author(s)
Advisor(s)
Level
Master'sDiscipline
ChimieKeywords
- Dynamique moléculaire
- Visualisation moléculaire
- Complexe aqueux
- Molécule d'eau
- Transfert de proton
- Cinétique
- Réaction acidobasique
- Mécanisme réactionnel
- Chimie computationnelle
- Simulation
- Molekel
- Mécanisme concerté
- Mécanisme séquentiel
- Molecular Dynamics
- Molecular visualisation
- Aqueous complex
- water molecule
- Proton transfer
- Kinetics
- Acid-base reaction
- Computational chemistry
- Concerted mechanism
- Sequential mechanism
- Chemistry - Physical / Chimie - Physique (UMI : 0494)
Abstract(s)
Les détails du mécanisme d’une réaction acidobasique sont encore nébuleux au sein de la communauté scientifique. Les résultats présentés dans cet ouvrage suggèrent un modèle mécanistique général basé sur la théorie de l’état de transition pour une réaction acidobasique en milieu aqueux. Ce modèle est proposé après l’analyse méticuleuse de 56 simulations mettant en avant-plan une réaction de transfert de proton entre le phénol et l’acétate dans l’eau. Cette réaction passe par différents nombres d’acteurs, incluant l’acide, la base et le nombre de molécules d’eau impliquées dans le transfert. Ce modèle général regroupe de nombreux mécanismes par lesquels le transfert de proton survient. Il s’agit notamment de procédés impliquant différents nombres de molécules d’eau intermédiaires (1, 2, 3, 4 ou 5), mais aussi des cas où l’acide entre en contact direct avec la base et des cas où la déprotonation de l’acide semble indépendante de la base. Cette proposition présente aussi une nouvelle définition quantitative des mécanismes concerté et séquentiel jusqu’ici différenciés qualitativement dans la littérature. The details of the acid-base reaction mechanism are still rather vague among the scientific community. The results shown in this document suggest a general mechanism predicated on the transition state theory for the acid-base reaction in an aqueous environment. This model is offered after a meticulous analysis of 56 computational simulations presenting a proton transfer reaction between a phenol derivative and the acetate ion in water. The number of actors greatly varies from one reaction to another, including the acid, the base and the numerous water molecules engaged in the transfer. This general model encompasses many sub-mechanisms leading to the proton transfer completion. Mostly, the processes involve different amounts of bridging water molecules (1, 2, 3, 4 or 5). Yet, it also showcases scenarios where the acid interacts directly with the base and some situations where the acid deprotonation seems to behave independently from the base. This proposal further offers a new, quantitative distinction between the concerted and sequential mechanisms rather than the until-now qualitative description in the literature.
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